Kreta was het centrum van Europa’s oudste beschaving, de Minoërs . Tabletten met de inscriptie Lineair A zijn gevonden op tal van plaatsen op Kreta en op enkele op de Egeïsche eilanden. De Minoërs vestigden zich op veel eilanden naast het oude Kreta : veilige identificaties van Minoïsche locaties buiten het eiland omvatten Kea , Kythera , Milos , Rhodos en vooral Thera (Santorini).
Archeologen hebben sinds Sir Arthur Evans het paleiscomplex in Knossos , de beroemdste Minoïsche vindplaats, geïdentificeerd en blootgelegd. Andere paleizen op Kreta, zoals Phaistos , hebben prachtige stenen paleizen met meerdere verdiepingen met drainagesystemen blootgelegd [5] en de koningin had een bad en een spoeltoilet. De getoonde expertise in de waterbouwkunde was van een zeer hoog niveau. Er waren geen verdedigingsmuren naar de complexen. Tegen de 16e eeuw voor Christus tonen aardewerk en andere overblijfselen op het Griekse vasteland aan dat de Minoërs verreikende contacten hadden op het vasteland. In de 16e eeuw veroorzaakte een grote aardbeving vernietiging op Kreta en op Thera die snel werd hersteld.
Rond de 15e eeuw v.Chr. vond er een enorme vulkanische explosie plaats die bekend staat als de De Minoïsche uitbarsting blies het eiland Thera uit elkaar en wierp meer dan vier keer zoveel ejecta als de explosie van Krakatoa en het genereren van een tsunami in de ingesloten Egeïsche Zee die wierp puimsteen tot 250 meter boven de zeespiegel op de hellingen van Anaphi, 27 km naar het oosten. Elke vloot langs de noordkust van Kreta werd vernietigd en John Chadwick suggereert dat de meerderheid van de Kretenzische vloten het eiland veilig had gehouden van de Griekssprekende vastelanders. De sites, behalve Knossos, werden verwoest door branden. Myceners van het vasteland namen Knossos over en herbouwden sommige delen die bij hen pasten. Ze werden op hun beurt opgeslokt door een daaropvolgende Dorische migratie.
